美国普林斯顿大学Britt Adamson、加州大学旧金山分校Jonathan S. Weissman等研究人员合作取得一项新成果。他们开发出直接向导RNA（sgRNA）捕获和靶向测序的组合式单细胞CRISPR筛选技术。2020年3月30日，《自然生物技术》在线发表了这一成果。
研究人员报道了直接捕获Perturb-seq，这是一种通用的筛选方法，其中表达的sgRNA与单细胞转录组一起测序。直接捕获Perturb-seq可检测单个细胞中多个不同的sgRNA序列，因此可将合并的单细胞CRISPR筛选轻松与包含双向导表达载体的组合扰动文库配对。
研究人员证明了这种方法对遗传相互作用高通量研究的实用性，并利用这种能力，剖析了胆固醇生物发生与DNA修复之间的上位相互作用。使用直接捕获Perturb-seq，研究人员还发现，针对每个细胞具有多个sgRNA的单个基因，这一技术可以提高CRISPR干扰和激活的效率，从而有助于将紧凑、高效的CRISPR库用于单细胞筛选。
最后，研究人员证明了基于杂交的靶标富集能够对来自单细胞RNA-seq实验的有用转录本进行灵敏、特异的测序。
据了解，单细胞CRISPR筛选可以探索哺乳动物的基因功能和遗传调控网络。但是，由于依赖于单个sgRNA的间接索引，该技术的使用受到了限制。
