另一起为股东集体诉讼。2018年12月，曾经的晶澳控股股东对晶澳控股、靳保芳和贾绍华提出一起推动股东集体起诉，指控晶澳控股2018年私有化过程中存在披露不实的情况，具体为晶澳控股在私有化的股东委托投票书中有错误陈述，其中包括晶澳控股表示没有在其他证券交易所再上市的计划等。据了解，目前该股东集体诉讼仍处在初级阶段。
对于上述诉讼纠纷，晶澳科技对记者表示，这两大诉讼指向的是晶澳控股，并不会对上市公司形成影响，即使存在赔付也不会对上市公司造成影响。
除了诉讼风险外，晶澳科技及其下属境内全资、控股子公司还存在部分房产权证和土地权证尚未办理等问题。
记者发现，截至2020年3月31日，晶澳科技及其下属境内全资、控股子公司正在使用但尚未取得房屋所有权证的房屋有43处，其中涉及30处部分生产基地和13处电站项目公司。截至反馈意见回复出具日，晶澳科技及其下属境内控股子公司正在使用但尚未取得土地权证的境内土地有12处。
针对尚未办理的房产权证和土地权证的问题，晶澳科技方面向记者表示，公司也希望尽快补办手续，包括交罚款。
此外，对于部分电站项目公司因未办理土地权证而存在未批先建的情况，晶澳科技方面并不否认，还表示这属于国内电站建设的普遍问题。“因为用地手续、建设审批手续与消纳并网时间窗口是错配的，企业会先建、补手续、补罚款，否则消纳指标是拿不到的。”
近几年，伴随业务规模扩大，晶澳科技应收账款持续攀升。2018年、2019年和2020年一季度，晶澳科技各报告期末应收账款分别为31.72亿元、38.89亿元和40.93亿元。
晶澳科技方面表示，应收账款增长较多主要源于光伏组件销量的增长及售电应收款的增加。公告也显示，2017～2019年晶澳科技的组件出货量从7.14GW提升到10.26GW；截至2020年一季末，其拥有正在运营的产生对外售电收入的国内电站项目合计579.51MW。
不过，值得关注的是，晶澳太阳能曾出现大额应收账款逾期的情况。相关公告显示，截至2019年6月，晶澳太阳能大额逾期应收账款余额为4.66亿元，占比11.79%。其中，其因预计无法收回或收回困难而单独计提坏账的应收账款余额为2.08亿元。
根据反馈意见回复，中国证监会要求说明晶澳科技应收账款减值计提是否充分谨慎；应收售电款未计提坏账的原因，是否与可比公司一致。
对此，晶澳科技对比隆基股份、东方日升和亿晶光电等同行公司表示，坏账准备计提比例不存在重大差异，坏账准备计提充分。另外，对于晶澳科技售电应收款中补贴电费回款较慢却未计提的原因，晶澳科技认为电站已经和国网公司签署购售电合同，对方信用水平高，预计发生信用减值风险可能性低。
应收账款之外，中国证监会还要求晶澳科技说明其他应收款中存在较大金额关联方往来的原因及合理性，是否存在关联方资金占用的情形。
记者注意到，近几年晶澳科技的其他应收款涉及关联方往来、押金、保证金、质保金、往来款、应收出口退税款、应收代垫款和备用金等。
根据反馈意见回复，2017年末，晶澳科技其他应收关联方款项10.18亿元，主要系公司与实际控制人控制的其他企业之间的往来款和资金拆借。不过，自2018年9月纳入合并体系后，上述资金拆借于2018年末全部清理。
年报显示，2019年晶澳科技其他应收款期初账面余额约4.77亿元，包括关联方往来2.25亿元，且2019年期末账面余额关联方往来变为0。反馈意见回复显示，2.25亿元关联方往来款项主要包括应收晶澳控股往来款和JA Development Co.,Ltd往来款，两家企业均为合并内关联方。截至2019年末，相关款项已经收回。
不过，记者发现，在晶澳科技2019年年度报告中，关联方应收应付款项目内，2019年期末账面余额却仍有3.5万元，主要涉及关联方晶龙实业集团有限公司和晶龙科技控股有限公司。
对此，晶澳科技方面向记者解释，该笔3.5万元资金用途为押金。该笔余额按款项性质分类既属于“关联方往来”，也属于“押金、保证金、质保金等”。经审计师确认，此类情况优先按照实际业务性质分类，因此进入“押金、保证金、质保金等”科目的余额，而未放入“关联方往来”科目。
晶澳科技方面表示，其他应收款关联方形成原因合理，报告期前期存在关联方资金占用情形，目前已经全部清理完毕。
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