企业披露2016年年报，企业实现平均营收约为1.65亿元，较上年同期增长14.77%，其中八成企业实现盈利。
2、行业方面，信息技术行业整体营收规模最大，实现1648.76亿元，超越机械设备排第一位;2016年营收增速最高的为互联网行业，为66%，然而其整体净利却由盈转亏，净利下滑189%。
截至2017年5月8日，共有10575家挂牌企业披露2016年年报，而有559家未能及时披露年报而被暂停转让，其中有21家已于4月30日后披露2016年年报，除了长潮股份外，均仍未恢复转让。
从盈亏来看，在10575家企业中，有8451家企业实现盈利，占比79.91%，较去年同期有所降低;增速方面，有7465家实现营收正增长，占比约为70.59%;有6028家实现净利润正增长，占比约57.00%。
据东方财富Choice数据终端统计，2016年新三板10575家已披露年报的挂牌企业实现平均营收约为1.65亿元，较上年同期增长14.77%;平均净利润约为1,085.30万元，较上年同期增长6.97%。与A股对比可见，A股企业整体业绩表现平稳，而新三板企业平均营收、净利增长较可观。
从各行业的营收表现来看，2016年，行业年度收入超过1,000亿元的有信息技术、基础化工、机械设备、互联网、有色金属、建筑等6个行业，其中信息技术行业整体营收规模最大，实现1648.76亿元，同时其企业家数占比最大，占比为15.57%。
净利润方面，超过100亿元的有金融、信息技术行业，其中金融行业稳居第一，实现年度净利139.98亿元，净利率高达20.52%。
从行业增速来看，净利率最高的金融行业年度营收、净利均有所下降，其余26个行业营收均较2015年上涨，其中互联网、钢铁行业增速高达66%、64%;净利增速方面，有22个行业实现正增长，占比约85%，其中，由于钢铁行业2015年净利基数较小，增速较大。
营收方面， 2016年度总营收高于100亿元的有4家企业，分别为钢银电商、金田铜业、南通三建、翰林汇，其中钢银电商超越2015年度营收第一的金田铜业，成为2016年度营收排名第一。从行业角度看，金融、商贸零售及基础化工行业企业上榜居多。
新三板在线研究中心统计，有六家挂牌企业于2016年未实现营收，且均持续亏损;分别为英极股份、苏州沪云、诺康医疗、康倍得、ST北安、中海康。
此外，更值得注意的是，有一家企业的营收为负数，为澳通电讯。根据企业年报披露，澳通电讯于2016年实现营收-50.84万元，系客户对项目的最终审计导致已确认收入的项目审减调整了当年的收入，由此合并后收入为负数。
净利润方面，可明显看出，金融、医药生物行业上榜居多，其原由主要是因为净利率较高。九鼎集团、齐鲁银行分别以20.47亿元、16.42亿元分居榜单第一、第二。
净亏损方面，2016年度亏损额超过5亿元的有3家，分别为神州优车、恒大淘宝、黑金时代。神州优车较2015年由盈转亏，于2016年亏损35.80亿元，居新三板亏损榜榜首。而2016年第二大亏损的恒大淘宝则为2015年的亏损榜首。
未避免上期数据过小而导致增速过大，新三板在线万元的企业进行统计，并作为本次榜单筛选结果的样本。
营收增速方面，于2016年实现营收增速10倍以上的有8家企业，分别为中琛源、海航期货、明石创新、星河科技、海高通信、合晟资产、易点天下、德林荣泽。其中，专注后向流量和语音的中琛源，2016年营收增长逾23倍，成为2016年营收增速最大的挂牌企业。
净利增速方面，于2016年实现净利增速超10倍以上的有26家，其中，海通发展、容汇鲤业分别以38.97倍、33倍分居第一、第二。
2016年，实现每股收益超过10元的有7家，分别为国瑞税务、合晟资产、传智播客、爱问科技、价之链、高思教育、爱用宝，其中国瑞税务、合晟资产以22.39、21.79元/股的每股收益高举榜单第一、第二。
新三板在线研究中心统计，新三板上共有30家企业ROE(加权)超过100%，其中宜搜科技以235.20%的净资产收益率高居榜首。而榜单中，以信息技术、互联网行业企业居多。
从行业来看，新三板总资产榜单前十明显以金融行业为主，其中齐鲁银行的总资产更是以2071.68亿元高居榜首。
2016年度负债排行榜前十全部为金融行业，其负债率也均超过50%。其中齐鲁银行以1942.89亿元的负债高居榜首，而负债榜的第二名与第一名的差距接近4倍。
目前，已公布2016年报的共有38家挂牌ST企业，其中负债率超过100%的企业共有28家，ST中试以1012.66%的负债率高居榜首。
在现金流充沛程度方面，传智播客以38.33元/股的每股经营现金流量高居榜首。而每股经营现金流量超过10元/股的共有11家。
新三板在线研究中心统计，新三板上销售毛利率超过90%的企业数量高达80家，且以信息技术、互联网等行业居多。此外，医药生物行业的欧琳生物以99.46%的毛利率居于榜首。
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