1993年9月17日正式开航。2005年深圳航空有限责任公司进行了股权转让，深圳汇润投资有限公司、亿阳集团有限公司受让深航65%股权，深圳航空成为民营资本控股的航空公司。2010年03月22日通过增资，中国国际航空持有深圳航空股权由原先25%增至51%，成为深圳航空的控股股东。2011年5月，深圳汇润24%股权被全程物流收购。截止2012年11月,深航共拥有波音747、737，空客320、319等各类型客货机逾百架，经营国内国际航线135条。
本人Lam kam Yuen在14/9號10:50分乘坐航班ZH9042由香港飛往晋江，當時飛機已經飛到接近目的地了，但因為天氣惡劣刮颱風无法降落的原因，所以飛機再飛往深圳機場降落，而且要自行回家，當時服務員只給本人一張航班取消的紙，就說如果有買旅遊保險的乘客可以用這張來证明的，當我交上保險公司的時候，保險公司不接受，并說要一張写明《由香港幾點起飛然後到達深圳機場的時間是幾點而且去不到目的地》的证明，請快快回復謝謝！！！
