无论是发行条件还是审核权力、定价机制以及交易机制等多个方面，科创板都与现有的主板、中小板、创业板有很多不同。
主板、中小板和创业板的发行上市条件，都只参考财务指标。主板、中小板对盈利的连续性和绝对金额要求比较高，创业板的盈利条件相对宽松，但都是需要企业连续盈利，才可以发行上市。科创板的发行上市条件，包容性就强得多，设计了5套标准，包括市值、营收、经营活动现金流、研发投入和产品的技术优势等综合因素。虽然也参考财务指标，但强调持续经营能力，不强调持续盈利能力。尚未盈利或存在累计未弥补亏损的企业，只要核心产品有明显技术优势，就可以在科创板发行上市。
主板、中小板和创业板都是核准制，由证监会发审委对企业的申报材料进行审核。科创板试行注册制，由上交所负责发行上市审核，证监会作出准予注册的决定。
主板、中小板和创业板，目前的定价机制，都是采用直接定价方式，原则上以静态市盈率23倍为发行价。科创板全面采用市场化询价的定价方式。科创板的发行，除了保留主板、中小板和创业板的网上+网下配售机制之外，网下配售对象从原来6类增至7类，引入私募参与网下询价配售。此外还试行保荐机构跟投机制、鼓励高管参与战略配售、引入绿鞋机制等，保证定价机制市场化。
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