卫生部门将重点检查医疗废物分类、收集、暂时贮存、集中处置情况以及不具备集中处置条件的机构自行处置医疗废物等情况。患者用过的棉签、纱布，医生丢弃的一次性注射器是如何处理的？患者在进行放射线检查时，是否穿戴和使用防护用品？此类场所有没有设置警示标志等市民普遍关心的问题，都是监督检查的重点。
生活饮用水和餐饮具集中消毒也是本次专项检查的重点。生活饮用水方面，将开展以规范日供水千吨以上集中式供水、学校自建设施供水和二次供水卫生管理为重点的专项监督检查，督促供水单位提高卫生管理水平；餐饮具集中消毒方面，将开展以规范餐饮具集中消毒单位生产行为、严厉打击无工商营业执照餐饮具集中消毒单位为重点的专项监督检查，督促餐饮具集中消毒行业提高整体卫生水平。
